Hola, no necesitas tener 2 servidores MySQL, puedes usar el mismo, ahora para poder conectar tu aplicación con Django a MySQL debes tener instalado MySQLdb para que Python pueda usarle, la instalación más sencilla y sin problemas es:
Código Shell:
Ver original$ sudo apt-get build-dep python-mysqldb
$ pip install MySQL-python
Luego para verificar si todo está correcto:
Si se importa correctamente (no lanza ningún mensaje a menos de que haya un error) ya estará listo.
Ahora solo queda que configures tu aplicación en settings.py para la conexión y crear los modelos respectivos.
Espero esto te sirva, saludos.