Mergear nuevos cambios de trunk sobre branches en uso

[ezefarina]

Hola gente, ando intentando reorganizar la manera en que utilizamos los repositorios pero tengo un problema.
No se estaba brancheando nada y se trabajaba todo sobre trunk. Entonces propuse que brancheemos por cada issue que atendamos en cada sprint (1 branch por issue por sprint). El tema es que venimos atrasados con algunos sprints. Entonces tenemos varios branches del nuevo sprint y varios branches del viejo. Todos en uso. Cuando se va a hacer deploy del viejo, se mergean los branches a trunk.
El problema estaría en que una vez hecho ese merge, los branches del nuevo sprint quedarían basados en un trunk viejo. Saben como podría solucionar esto?
Me sería de gran ayuda

Muchas gracias !!