claro internet explorer es una basura para interpretar codigos la verdad tu pagina web se ve sumamente diferente en internet explorer que en firefor y no tiene los efectos del menu
una cosa que podrias hacer es instalar el plugin de internet explorer compatibility y activarlo
como ya no esta en el joomla extencion directory lo subi aqui
http://www.mediafire.com/?jqckjmxkzu2g5o1
espero te sirva ese yo lo uso para mi sitio y la verdad hace que la diferencia de visualizacion no sea tan avismal aunque podria ser mejor pero asi es internet explorer que se le va ha hacer