Hola:
En principio el efecto fade no es más que un cambio de la opacidad del elemento al que se le aplique... y si se aplica al body de la página, se mostrará la página entera con el efecto... para conseguir el efecto (no importa si se usan librerías o no) habría que poner una capa encima del body con los estilos adecuados para poder aplicar el efecto... dudo de que las librerías te ayuden, pero moveremos el tema para ver si te pueden ayudar...
Saludos
