Código:
$email_clt= $_POST['email_clt'];
$query_valida=("select * from cliente WHERE email_clt= '$email_clt' ");
$respuesta=mysql_query($query_valida);
$total=count($respuesta) ;
if($total==0)
{
//ENTRA AL CODIGO CON EXITO YA QUE EL USUARIO NO EXISTE
}
else
{
//...ERROR
}
Prueba a ver si así funciona.