programacion de la shell de linux para comparar ficheros

[adalsuper]

Muy buenas tengo un problema con una practica que no sabemos como plantearla y tampoco hacerla muy bien.
La practica seria:
un script con el que se determine el porcentaje de coincidencias entre una serie de ficheros localizados bajo una serie de directorios.
Todos los directorios con los ficheros a analizar se encontrarán bajo un único
directorio. Directorio y script tendrán el mismo nombre.
los nombres deberan ser localizados. pero ambos nombres serán iguales

gracias de antemano.