en el HTML a el enalce en cuestión
Código:
<a href='#top'><span></span>Arriba</a>
le pondría un id:
Código:
<a id="boton_arriba" href='#top'><span></span>Arriba</a>
y en los estilos añadiría esto:
Código:
a#boton_arriba{
z-index:50; /*Con esto seguramente ya es suficiente pero te quedara montado sobre lo negro*/
position:relative;
bottom:60px;
/*con esto ultimo lo subes un poco de su posición natural*/
}