No uso Dreamweaver para esto por lo que no se guiarte entre las opciones que te pueda ofrecer. Y ademas no seria tema de este foro.
La estructura de tablas que te he puesto es la correcta para lo que estas haciendo, no uses los atajos que ofrecen los programas sin analizarlos.
La idea es, como sabes el idUsuario, sea por que esta logueado, o por que se ha elegido previamente, con esta información el selector de vacunas debe generar tantos registros como vacunas se elijan en la tabla de relación.
Luego te sera muy facil obtener la lista de vacunas de un susuario concreto...
Código MySQL:
Ver original u.nombreUsuario,
v.idVacuna,
v.nombreVacuna
(RelUsuVacuna r
TVacunas v
ON r.idVacuna
=v.idVacuna
) ON u.idUsuario
=r.idUsusrio
o las vacunas que le faltan a un usuario concreto
y asi lo que sea....