Hola:
Cuando usas los corchetes, el punto "anterior" debes omitirlo:
Código:
document.formulario.['cuota[]'].value.length
...
Y si realmente se trata de un array (o sea, hay más controles con el mismo nombre), debes usar el índice...
Código:
document.formulario['cuota[]'][0].value.length
...
Saludos