relación de tablas

[Blashak]

Buenas,

He visto que a veces cuando hacen una relación entre dos tablas ponen una tabla por medio con los ids de cada tabla.
Cuando se tiene que hacer esto???

ejemplo:

tabla presupuesto
id = 0;

tabla envio
id = 1;

tabla presupuesto_envio

id = 0;
id_presupuesto = 0;
id_envio = 1;

yo lo que hacia era poner la id de unas de las tablas en la otra tabla sin crear ninguna tabla por medio.
cual es la diferencia ??

ejemplo:

tabla presupuesto
id = 0;

tabla envio
id = 1;