Lo puedes hacer mas fácil con jQuery, con php lo puedes hacer validando formulario por medio de get o post, algo como esto:
<?php if(isset($_GET['mi_formulario'])){ ?>
<div id='popup'><a href='url.php?tuvar=valor'>aceptar</a><a href='url.php?tuvar=valor'>cancelar</a></div>
<?php } ?>
tu le das el formato con css al div y los links, espero te funcione
este seria tu form de ejemplo
<form>
<input type='submit' value='hola' name='mi_formulario'>
</form>