Yo trabajo mucho con ecommerce y cuando hablamos de transferencia bancaria, como método de pago en el checkout, solo es mostrar la información necesaria para que el cliente pueda llevar acabo una transferencia ya sea en el banco o en el banco en linea.
La compra en el sistema se debe guardar con status pendiente y cuando se valide que la transacción ha sido echa se debe liberar.
Cita:
Iniciado por repara2 
Una transferencia en sentido clásico no creo que sea posible porque en una transferencia intervienen dos bancos, origen y destino. Destino será siempre tu banco, pero origen tiene infinitas posibilidades.
Como dice repara2, una transferencia clásica no es posible.
También puedo comentar que tramitar una terminal con cualquier banco, al menos en México, es un caos y se debe cumplir con muchos requisitos. Es mas recomendable usar algún intermediario (PayPal, DineroMail, etc) para poder aceptar pagos en linea.
Espero esto te sirva.
Saludos!