Supongo que debes usar alguna query para llamar a los campos personalizados. Ya que suelen crearse para crear contenido separado de the_content y utilizable para otras tareas.
En este enlace tiene información sobre eso:
http://codex.wordpress.org/Custom_Fields
Para añadir algo al final de un post, dentro de the_content, puedes añadir una función como esta en functions.php o usarla en forma de plugin:
Código:
function insertar_contenido($content) {
if(!is_feed() && !is_home()) {
$content.= "<div class=''>"; //aquí la clase que quieras si quieres en forma de div, de parrafo o de lo que quieras
$content.= "<h4>Titulo para contenido añadido</h4>"; //si quieres que lleve título
$content.= "<p>Aquí el contenido añadido con <a href='http://ruta-a-enlace'>enlace</a> o sin enlace.</p>";
$content.= "</div>";
}
return $content;
}
add_filter ('the_content', 'insertar_contenido');
Espero que bien el enlace o la función te sirvan. ;)