Es posible crear, leer y escribir datos con File API (
http://www.w3.org/TR/file-writer-api/). De esta manera es posible trabaja con BLOB (archivos binarios grandes)
El límite teórico de 5MB es para las de base de datos (DOM storage) y está dado por los navegadores, en realidad en algunos casos el límite recomendado es menor.
Saludos y gracias :)