Ok , otra cosa que debes de saber es que php se ejecuta del lado del servidor primero que javascript o sea que
Código:
<script type="application/javascript">
function setNumero(){
<?php $Numero= 34?>
}
</script>
<?=$Numero?>
Para que la variable Numero obtenga el valor de 34 no tengo que llamar a la funcion de javascript setNumero.