Bueno, este es un método poco ortodoxo (supongo) para que el cursor parpadeé, pero resulta.
Código:
<html>
<head>
<script language="JavaScript">
ver=1;
function parpadeo(){
if(ver>0)
{document.getElementById("cursor").style.visibility='hidden';}
else
{document.getElementById("cursor").style.visibility='visible';}
ver=ver*(-1);
setTimeout('parpadeo()',500)
}
</script>
</head>
<body onLoad="parpadeo()">
<div id="cursor">_</div>
</body>
</html>
Si quieres hacer que parpadeé más rápido disminuye el número que está en rojo, y más lento, pues lo aumentas.
Sobre lo de que me mandes el código,....
podemos probar. Lo que si que no sé es cuando te voy a poder responder, ya que ahora estoy de exámenes y ando un poco liado. Puede que alguien se anime a entrar en la conversación y nos ayude.
Por cierto, si no me equivoco, estás intentando hacer algo parecido a lo que le pasa al ordenador de Neo en The Matrix. Si es así, creo que hay por ahí un código de Javascript que hace lo mismo. Si me acuerdo dónde lo he visto te lo pongo, pero puedes usar un buscador para encontrarlo tú mismo.
Un saludo.
Aquí está el efecto Matrix
http://javascript.internet.com/bgeffects/matrix.html