Si, puede ser que tengas algún problema según como tengas hechos los links a los estilos.
Te dejo un ejemplo funcionando, con dos variables, fijate que si reconoce los estilos y el javascript y que las rutas de estos en el html son absolutas, es decir empiezan por /, usá el ejempo de htacces de esa página.
Demo:
http://mr1.emprear.com/
Saludos