Cita: No avisa si te han mandado mensajes nuevos, es decir... no se te abre ni una ventana cuando tienes un mensaje nuevo ni nada...
Bueno, ésta sería la parte más problemática de tu chat.
Yo realicé uno que lee periódicamente mediante llamadas ajax, y estoy pensando en manejar comet o similar cuando le pueda dedicar algún tiempo.
En mi caso, el sistema se basa fuertemente en javascript, ya que para minimizar la carga del servidor leo cada 10 segundos y sólo contesta el texto sin formato, siendo javascript quien formatea la cadena, la agrega a la plática, abre la ventana de conversación en caso de ser necesaria, controla el scroll y avisa mediante notificaciones de escritorio de chrome,sonidos y parpadeo de título si hay nuevos mensajes. No sé si mi comentario te aporte algo, es una sincera crítica constructiva, y si te interesas por alguna de las características que te mencioné de mi chat, puedes preguntar en algún post.