Djanko, el Apache es mucho mejor....
solo hay un probemita ... Teniendo un servidor windows, quizás quieras soportar ASP, el lenguaje de microsoft, y con el servidor apache, por mas que este corriendo sobre una plataforma windows, NO tienes soporte del mismo.
Si eliges apache, lo mejor sería correrlo en un linux/unix/bsd
Saludos.