ufff pues conozco muchos CMS para tiendas en linea, y pues a mi se me hacen muy atractivas te dejo la lista para que veas cual te fuciona mejor ;)
http://oscommerce.com/ http://www.magentocommerce.com/ http://www.zen-cart.com/ http://www.opencart.com/ http://www.digistorecommerce.com/ http://www.prestashop.com/
recuerdo que todos son gratuitos espero te sirvan