He descubierto que si pongo src="nominas/HTML.pdf" si que es capaz de mostrarlo.
Por lo que he cambiado el $directorio = "nominas"; del archivo upload.php que he creado al principio para que en la base de datos me guarde en el campo de url únicamente > nominas/nombre_del_archivo.pdf
Así que esta claro que algo hago mal en el siguiente select, pero no consigo solucionarlo
Código PHP:
<?php
$busqueda = ("SELECT nominas.url FROM nominas WHERE nominas.usuario= '".$_SESSION['k_username']."'")
or die ('Error al seleccionar la Base de Datos: '.mysql_error());
$pdf = $busqueda['url'];
echo '<embed src="'.$pdf.'" width="500" height="600"></embed>';
?>