Mantener un div Visible cuando cambia la url

[iovan]

Pues si no quieres ver ni un parpadeo como dices, entonces has un sitio web puramente en AJAX. Es decir recoge toda la información de todas las partes de tus páginas web usando ajax y scripts en PHP, con el mismo js lo introduces dentro de los divs según corresponda y con pushstate darás la impresión de haber cambiado de link.

Edito: Ah acabo de ver el comentario de gator y si es exactamente lo que dije así que perdón por la redundancia.
Ya que estamos, no tienes porque hacer que los scripts PHP que consultas por ajax sean también accesibles mediante el navegador, pero si lo haces:

* Cuando consultes por ajax recomiendo pasar un parametro para que lo relaciones con una consulta AJAX y devuelvas una respuesta adecuada (No necesariamente en HTML)

* Cuando no exista este parametro, entonces el usuario ha accedido al recurso desde otro medio, por lo tanto imprimes todo el contenido de la página como normalmente lo haces.

listo.