Las Instancias las puedes obtener de la siguiente manera:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/a6t1z9x2.aspx http://programandoenpuntonet.blogspo...rver-y_12.html
Ahora bien para armar tu cadena de conexión la instancia seleccionada se la concatenarás.
Data Source= " & MyServer & ";Initial Catalog=myDataBase;User Id=myUsername;Password=myPassword;
Donde MyServer sera la instancia seleccionada. Dicha variable se la puedes mandar a tu clase conexión y listo.
Saludos!