Hola rodriguezalb,
En la rama de MySQL 5.0.x, la versión más reciente es 5.0.95.
Actualizar o no actualizar, depende de una gran variedad de factores, particularmente me gusta trabajar con las versiones más recientes y sería mi recomendación, sin embargo, esto en ciertos contextos puede ser costoso, complicado, no necesario, etc..
Para actualizar, puedes leer la siguiente sección del manual
2.11.1. Upgrading MySQL.
En versiones inferiores a MySQL 5.5 pienso será difícil una solución rápida o poco trabajada para lograr lo que necesitas.