Contar registros por Grupo, Sibgrupo, subtotales y totales

[PIRRUMAN]

puedes empezar usando ciclos:

$sqlgrupos="select idgrupos,nombregrupo from grupos"
$resgrupos=mysql_query($sqlgrupos)
while ($grupos=mysql_fetch_array($resgrupos))
{
print $grupos['nombregrupo']."<br>";
$sqlsubgrupos="select fkgrupo,nombresubgrupo from subgrupos WHERE fkgrupo=$grupos['idgrupos']";
$ressubgrupos=mysql_query($sqlsubgrupos);
while($subgrupos=mysql_fetch_array($ressubgrupos))
{
print $subgrupos['nombresubgrupo']."<br>";
}
}