Hola de nuevo.
Parece ser que el error es porque esa línea no está dentro de una función. Si la pones dentro de alguna función no da problemas.
Si, como yo supongo, necesitar inicializar esa variable al principio puedes poner algo así:
<script>
var referencia;
function ini() {
referencia = document.forms[0].elements[1].value;
}
</script>
Y la llamas con:
<body onLoad="ini()">
Espero que te sirva. Saludos,