¿y este centro no tiene gestor? ¿no hay más autónomos trabajando para ellos? es que depende del centro y formación, si es reglado o no.
Como vas a facturar como autónomo y por esa actividad (recuerda darte de alta en el epígrafe correspondiente) sí tendrás que retener irpf. Lo que no sé si con IVA o no (por lo del centro)
Actividades exentas de IVA:
http://www.serautonomo.net/actividad...as-de-iva.html
por otro lado he encontrado este post que parece similar a tu caso:
http://foros.abanfin.com/viewtopic.p...on+iva#p164777