@AitorLopez
Varias cosas, en primer lugar que además del tema de la codificación, lo que mostras se vincula a algo que tratamos en otro post respecto de utilizar carpetas de red para crear alias o utilizarlos como documentRoot de virtuahosts.
Vamos primero con lo de la codificación, cuando hablamos de codificación nos referimos a dos cosas puntualmente, a la codificación que utilizó nuestro editor de texto para guardar el archivo y a la instrucción que le das al navegador para que reconozca que codificación usaste (ya sea via un meta ó un header), ambas deben "coincidir" por supuesto.
nigún archivo
"no tiene codificación", todos la tienen.
Te recomiendo la lectura de
http://foros.emprear.com/codificar
Insisto, el charset de la página que contiene el iframe no tiene porque afectar la visualización del archivo cargado en el iframe si este, como se desprende de lo anterior, tiene coincidentes el charset y la codificación con que se guardó en el editor de texto.
Pero aqui se presenta otro problema, lo que cargas en tu iframe.
está todo dentro del mismo dominio? si es así, que significa
Cita: si en vez de carga el archivo desde su ubicacion original, es decir, desde la unidad de red, lo cargo desde el servidor
Se supone que siempre lo vas a cagar desde el servidor y a través del navegador, no entiendo esa diferencia.
Por lo que decís intuyo (no lo puedo afirmar) que estás guardando los archivos como utf-8 en el editor y que tu servidor está pasando por defecto un header iso-8859-1
Si querés usar utf-8, lee el articulo que te mencioné, y agregá en la raiz de tu domicio, en el .htaccess
AddDefaultCharset utf-8
SAludos