Filezilla, es un cliente FTP y un Servidor FTP, por lo tanto, si querés transferir archivos a una de tus PCs de la red, tenés que instalar en esta un Servidor FTp, que se descarga desde
http://filezilla-project.org/
Una vez instalado y configurado el servidor, usas el cliente en el resto de las pcs para transferir los archivos
Nada tiene que ver este proceso con la compartición de carpetas en la red interna o el mapeado de carpetas compartidas a unidades de red
Saludos