El problema está bajo la licencia GPL, lo cual permite tener acceso al código fuente.
Lo mejor es enviar informe de tu problema a la página oficial, donde las personas encargadas de desarrollar el software puedan ayudarte o solucionar el problema en nuevas versiones en caso de ser necesario.
Saludos.
El enlace de contacto es el siguiente:
http://www.gvsig.com/contacto