Confirmado la parte que el json no tiene nada que ver sino que es la petición en ajax y en como afecta que la página se haya cargado
Porque acabo de hacer una prueba simple de cargar un archivo desde ajax, de esta forma
$("#test").load("/secciones/test.php");
<div id="test"></div>
Y dentro del archivo un trozo de código de la web donde sí funciona el tooltip
<a title="Vista Tabla" class="vtabla poshytip" href="#"></a><a title="Vista Lista" class="vlista poshytip" href="#"></a>
y sin embargo dentro del div test tampoco funciona
Tiene que ser algo del DOM que los JS no tienen afectación sobre los datos cargados desde ajax :S