Cuando vos decís
El sitio está en: /www/sitio_web/
eso que significa? que /www/sitio_web es tu documentroot, o tu documentroot es /www y alli creaste una carpeta llamada sitio_web ?
porque son dos cosas muy diferentes
te doy dos posibilidades
si para acceder a index.html, tenés que escribir
http://localhost/sitio_web/index.html
el origen para tus flash, debería ser
/sitio_web/swf/archivo.swf
si para acceder al index, solo escribis
http://localhost/index.html
el origen debería ser
/swf/archivo.swf
SAludos