Efectivamente con JQuery lo puedes hacer, no se exactamente como lo deseas hacer pero algo asi podria ser, suponiendo un caso.
Sea <div id="barra"></div> el div que contiene a la barra.
$(document).on('ready', function(){
var posicionActual, posicionNueva = 0;
$(window).scroll(function(){
posicionNueva = $(this).scrollTop();
if(posicionNueva>posicionActual){
$('#barra').hide('slow');
} else if(posicionNueva<posicionActual){
$('#barra').show('slow');
}
posicionActual=posicionNueva;
});
})
Es masomenos un ejemplo pero depende como exactamente lo quieras implementar, espero que te sirva.