No te entiendo demasiado bien...
¿La variable C la tienes en JS o en PHP?
¿No te funciona si se la añades igual que añades a la de FTP?
Código:
displayfiles: ['samplecontent.asp?ftp=2&c=blabla']
Si la variable la tienes en PHP pues la cargas...
Código:
<?php
$c = Blabla;
?>
displayfiles: ['samplecontent.asp?ftp=2&c=<?php echo $c;?>']