Las diferencias entre cada versión son muchas como para comentarlas en el foro, te recomiendo que veas la sección Nuevas Características (New Features) de la documentación oficial en
http://docs.oracle.com/cd/B28359_01/...1.htm#NEWFTCH1 para la release 11.1 y
http://docs.oracle.com/cd/E11882_01/...e22487/toc.htm para la release 11.2.
En cuanto a la certificación, debes evaluar varios factores, por un lado siempre es mejor hacer los exámenes sobre la última versión, esto supone que tus conocimientos están actualizados además de tener un certificado con más tiempo de validez, pero por otro lado, puede que los cursos sobre 10g no sean suficientes para certificar en 11g ya que los exámenes también cambian, en estos casos, mucha gente certifica en 10g y luego hace un examen adicional de actualización a 11g. Más info en
http://education.oracle.com/pls/web_...?page_id=143#1
Saludos