Puedes usar una expresion en lugar de la tabla...
Código:
SELECT *
FROM(
SELECT rpe, cl_incid
FROM mitabla
WHERE cl_incid IN ('026', '050', '067')
AND rpe IN ('76880','9ATE5')
) r
PIVOT ( count (cl_incid)
FOR cl_incid IN ([026], [050], [067])
) AS pvt
ORDER BY 1
Saludos!
P.D. Esto no funciona en SQL 2000.