Cita:
Iniciado por DrFaust 
A mayor Z-Index, más "arriba" está el elemento.
Ya probe a cambiarlos, por ejemplo:
#logoinicio{z-index:200;}
#wrapper{z-index:100;}
Indicar que el wrapper es el contenedor de toda la web.
Pero sigue igual, para que me entiendan. Ahora mismo cuando carga la pagina en la parte superior aparece el div #logoinicio que hace su FadeOut y su fadeIn, pero en la parte inferior aparece la web y cuando desaparece el logo la pagina salta y esto es lo que quiero evitar.