Hola,
de lo que indicas deduzco que sabes bastante de programación, por lo que mi recomendación es comenzar por aprender css, si programas se te hará muy sencillo, con respecto a la herramienta a mi juicio lo mejor es dreamweaver pero es de pago, si quieres una gratis y bastante buena aptana, un buen test pata tu web integral a (también indica velocidad de la página)
http://www.woorank.com/ es para seo, pero es muy útil.
Con respecto a los gráficos, en mi caso personal soy pésimo para el diseño (dibujar cosas bonitas) jeje por lo tanto de acuerdo a mi experiencia te recomiendo Fireworks que es más sencillo y es ideal para la web, es como photoshop pero enfocado a web.
Saludos