Truncate table o Delete

[bhonox]

Buenas,

quisiera preguntar un tema que tengo una curiosidad:

Tengo 2 esquemas de base de datos A y B
A tiene la tabla 1
y B tambien tiene la tabla 1

la tabla1 de B se carga de la siguiente forma
a) se trunca la tabla
b) se insertan todos los registros de la tabla 1 de A en tabla 1 de B

es decir se replica se forma completa...

la pregunta es, que pasa con los indices?
porque es mas lento acceder a B si son los mismos datos?

obviamente se hace un rebuild y se mejoran, pero es posible que en vez de truncate usara DELETE no seria necesario hacer el rebuild?

Agradezco a los q me asesoren...

Saludos.