Hola eragas, puedes implementar en tu index una función javascript que detecte el navegador del usuario, y en función del navegador,enlace con un css determinado.
En tu caso, cuando el navegador sea explorer que enlace con su css.
Aquí tienes el enlace a esta función javascript
:
http://www.desarrolloweb.com/articulos/estilos-css-distintos-navegador-javascript.html
Suerte
Daniel