Yo lo probaria asi:
Código PHP:
Ver original<?php
include("conexion.php");
$dbi = Conectarse();
$rut=$_POST[rut_cuenta];
$query = "SELECT * FROM cuentas WHERE rut = '" . $rut . "'";
// Si es mayor a 0 es que tiene resultados
$data['existe'] = true;
} else {
$data['existe'] = false;
}
// Se realiza el encoding para transformarlo a un objeto de json, para manipularlo mas facil en el ajax, este valor es el que en el ajax se evalua en el if (data.existe)
?>
Probalo y avisame ;) copia y pega tal cual en tu php