Si lo que quieres es adaptar un diseño que ya tienes maquetado en HTML, CSS y su correspondiente pacotilla con Javascript, JQuery y esas cosas, te voy a decir lo que yo hago. Tan sencillo como que uso Twenty Ten como framework, pues ya no tengo que codear todo el theme desde cero, solo alguna que otra funcionalidad específica y modificar el CSS, es algo que pudieras hacer.
Lo otro es familiarizarte con las funciones de Wordpress.
http://codex.wordpress.org/Function_Reference/
Saludos