Gracias Nekko como siempre
Actualizo porque ya está arreglado, al final eliminé los plugins para que no dieran problemas, actualicé manualmente, hice el upgrade a la base de datos y listo. Luego arreglé algunos problemillas de plugins que tenían código en el theme y demás pero no fue tan faeonoso como parecía.
Consejo para el que llegue a este topic en mi misma situación, copia de seguridad de la base de datos, de la carpeta uploads y del theme.