Bueno. En el caso de España nos encontramos con ciertos problemas. Existen varios sitios (llamémoslo asi), que chocan entre sí a la hora de chequear los derechos de autor. Por ejemplo la nueva LSSI, que se refiere en varios de sus apartados a la publicación total o parcial de documentos, de cualquier tipo, con o sin el consentimiento del autor.
No estoy muy enterado del funcionamiento de esta ley (que en tu caso te afecta directamente, ya que creo haber entendido que vas a publicar una animación en flash reproduciendo música clásica).
Sé que en algunos ayuntamientos de España se encuentran tambien distintos tipos de oficinas relacionadas con el registro de derechos.
También hay una Sociedad General de Autores (SGAE), a la que puedes consultar todas tus dudas. Su dirección es
http://www.sgae.es
Saludos. Taita