Creo que cuando te refieres a roles es al nivel de acceso de los usuarios a las funciones sistema que se quiere implementar...
por ejemplo, los roles que usa esta página (según tengo entendido) son "administrador","moderador" y "usuario"... y (según tengo entendido) hay un módulo para cada rol, en el caso de este foro, un rol de usuario no puede ser igual al rol de un administrador, así que no entiendo esa parte que comentas de que un usuario puede tener varios roles...
Es algo confuso lo que estás proponiendo, deberían revisar desde la conceptualización de la base de datos, lo que te propongo es crear los módulos necesarios para cada rol y, además, creo que tienes 3 tablas en una, creo que deberías hacer una tabla que quede algo así:
login pass rol email
user 1234 1
[email protected]
user2 4321 2
[email protected]
user3 2011 3
[email protected]
Slds.