Tienes un montón de código innecesario, puedes hacer algo así:
Código PHP:
Ver original<?php
$indicar = explode(",",$cate["grpCategorias"]);
foreach ($Res as $cate) {
//Los imprimo seleccionados
} else {
//Los imprimo sin seleccionar
}
}
Tomalo de ejemplo no es para copiar al pie de la letra.
Saludos.