Si el contenido del IFRAME, es decir el HTML del reporte tiene su codificación y charset, seteado al igual que todo el sistema:
Código HTML:
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
<html>
<head>
<title>Reporte</title>
<link rel="shortcut icon" href="http:../../favicon.ico" />
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"/>
y es por ello que se muestra perfectamente cuando no esta en el IFRAME...
