Lo que debes de hacer es no usar un link para cargar las cosas al carrito, utiliza como ya te mostraron anteriormente un formulario, donde con <input type="hidden"> declares las variables, y posteriormente tengas el link que haga el submit del formulario, así deberían de pasar todas las variables.
Por ejemplo:
Código PHP:
Ver original<form action="carro_agregar.php" method="get" id="submitForm">
<input type="hidden" name="cod_articulo" value="<?php echo $fila['cod_articulo']; ?>" />
<input type="text" name="cantidad" value="1" />
</form>
<a href="javascript:document.getElementById('submitForm').submit();">Agregar al carrito</a>
Obvio tienes que pensar las cosas de forma un poco más optimizada para poderlo hacer con varios productos.
Saludos.