Si refieres a los que tienes cosas interactivas (como el de la guitarra) no hay ningún programa. Están echos con Javascript, CSS y HTML. Puedes ver el código de los logos aquí:
http://www.google.com/logos/
Si es de los sencillos, pues si hay programas como Photoshop, pero es el diseñador el que hace el trabajo.
Saludos
