Muchas preguntas de una vez, vamos por partes.
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Iniciado por carrodepandora 
Mi página actual está realizada en HTML y CSS. Me gustaría cambiarla a JOOMLA, para poder cambiar contenidos con más facilidad y frecuencia y así poder posicionarla mejor; pero por otra parte no se si la estructura de Joomla es la más adecuada para el posicionamiento. No se cómo la lee google y si puedo añadir las metas.
Joomla tiene muchas opciones (plugins) para SEO, depende de cuánto lo optimices dará mejores o peores resultados.
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Iniciado por carrodepandora Por otra lado, tengo tres palabras clave ya posicionadas que me gustaría mantener. He leido que para ello necesito mantener la estructura de las URLs, algo del PR y la posibilidad de usar redirecciones 301, pero no me ha quedado nada muy claro.
La estructura de las urls es que mantengas los nombres de las páginas. Si google tiene ya indexada la página
dominio.com/keyword.htm tienes que seguir manteniendo la url
keyword.htm o en su defecto hacer una redirección 301 a la página donde esté ahora el contenido de esa página.
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Iniciado por carrodepandora Quisiera saber también si el posicionamiento va exclusivamente por categoría o el posicionamiento de una categoría afecta al resto de la página.
El posicionamiento va por páginas. Las páginas de un mismo sitio se transmiten relevancia si están entre ellas enlazadas.
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Iniciado por carrodepandora Dejo caer otro tema: ¿es mejor elegir las keywords de mayor competencia u otras de menor, pero que haya más posibilidades de encabezarte en google?
Depende de cómo de competidas estén, en algunos casos llevaría años alcanzar los 10 primeros puestos, no vas a estar todo ese tiempo sin nada ¿no? Hay que buscar un equilibrio. Investiga un poco el concepto
long tail.